Las iniciativas financiadas buscan entender mejor el papel del microbioma en la salud reproductiva y avanzar en el estudio de la epitranscriptómica. El Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio), centro de investigación del Parc Científic de la Universitat de València, colaborará con Endorenew y Longseq para el desarrollo de estos proyectos
Dos proyectos del Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio), ubicado en el área científico-académica del Parc Científic de la Universitat de València (PCUV), han sido seleccionados en la tercera convocatoria del programa CSIC COCREA 2025, orientado a impulsar la colaboración entre grupos de investigación y empresas en ámbitos de alto impacto tecnológico. Entre las diez propuestas aprobadas a escala nacional, dos corresponden al grupo de Genómica de la Expresión Génica, dirigido por la investigadora Ana Conesa.
Este programa, que forma parte del hub de innovación abierta del CSIC Converge, financia proyectos de innovación abierta destacados por su novedad, su capacidad para generar propiedad industrial y su potencial de aplicación. En esta edición, la selección de propuestas ha atendido a dos líneas estratégicas dentro del ámbito de las tecnologías disruptivas: por un lado, soluciones basadas en inteligencia artificial y tecnologías cuánticas; por otro, el desarrollo de materiales avanzados con alto valor añadido y menor impacto ambiental.
Los dos proyectos concedidos al I2SysBio se enmarcan en la primera de estas líneas, y buscan abordar dos cuestiones de gran interés clínico en el campo de la biomedicina: la salud reproductiva femenina y el estudio de la epitranscriptómica mediante secuenciación avanzada. Ambos proyectos tienen una duración prevista de dos años y cuentan con una financiación de 100.000 euros cada uno.
El papel del microbioma en salud reproductiva, con Endorenew
El primer proyecto, desarrollado en colaboración con la empresa Endorenew, investigará el papel del microbioma y de la expresión génica del endometrio en la fertilidad mediante la integración de datos ómicos. El equipo combinará transcriptómica de célula única (scRNA‑seq) y metagenómica (WMS) para obtener un perfil multiómico integral del endometrio en condiciones fisiológicas y patológicas.
El estudio analizará muestras de aspirado endometrial recogidas durante la ventana de implantación y muestras fecales de mujeres fértiles e infértiles, incluidas pacientes con síndrome de Asherman, endometritis crónica o endometriosis/adenomiosis. La investigación permitirá mapear los cambios transcripcionales de los distintos tipos celulares del endometrio y correlacionarlos con la composición microbiana, con el objetivo de identificar biomarcadores que puedan mejorar el diagnóstico y la personalización de tratamientos en medicina reproductiva.
Desarrollo de herramientas para la epitranscriptómica, con LongSeq
El segundo proyecto, en colaboración con Longseq, se centra en el desarrollo de una herramienta bioinformática innovadora destinada a aprovechar todo el potencial de la secuenciación por nanoporos para el análisis conjunto de la transcriptómica y la epitranscriptómica. A partir de SQANTI3, una plataforma creada previamente por el laboratorio de Conesa para la caracterización exhaustiva de isoformas a partir de datos de long‑reads, el equipo adaptará y ampliará su funcionalidad para interpretar señales crudas de dRNA‑seq, detectar patrones de modificaciones epitranscriptómicas y, además, integrar la identificación de mutaciones puntuales en transcritos.
El objetivo es desarrollar una herramienta robusta y versátil que permita avanzar en la comprensión de la epitranscriptómica en salud y enfermedad, abriendo nuevas oportunidades para la medicina de precisión y el desarrollo de estrategias de diagnóstico temprano y potencial diana terapéutica.
Sobre Ana Conesa Cegarra
Ana Conesa es profesora de investigación en el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y profesora asociada en la Universidad de Florida (EE. UU.). Es miembro numerario de la Real Academia de Ingeniería de España, miembro honorario de la Sociedad Española de Bioinformática y Biología Computacional, y miembro de la Junta Directiva de la Sociedad Internacional de Biología Computacional.
Su laboratorio en el I2SysBio, ConesaLab (Conesalab), desarrolla métodos y herramientas bioinformáticas para analizar diversos aspectos de la biología del transcriptoma, incluyendo el procesamiento del ARN, los cambios dinámicos, la regulación, las interacciones y la función. Desde ConesaLab han creado más de veinte herramientas de software utilizadas por decenas de miles de investigadores en todo el mundo. Asimismo, ha sido pionera en el desarrollo de métodos computacionales para aplicar tecnologías de secuenciación de una sola molécula al análisis de transcriptomas.
Conesa ha liderado numerosos proyectos internacionales y consorcios de investigación en biología computacional, coordinando más de treinta equipos internacionales y asegurando fondos de la Comisión Europea, los Institutos Nacionales de Salud de los Estados Unidos (NIH), la Fundación Nacional de Ciencias y la NASA, entre otros. Se desempeña como asesora de agencias de financiación e institutos de investigación en todo el mundo y ha diseñado e impartido cursos de bioinformática en los cinco continentes, capacitando a más de mil investigadores. También es la fundadora y ex directora científica de Biobam Bioinformatics, una empresa que desarrolla software fácil de usar para la investigación genómica. Además, ha sido recientemente elegida vicepresidenta de la Sociedad Internacional de Biología Computacional.
No te pierdas la entrevista con Ana Conesa en nuestra sección de Nosaltres STEM
Fuente: I2SysBio
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