El grup d'investigació de Mária Džunková, de l'Institut de Biologia Integrativa de Sistemes (I2SysBio), situat en el Parc Científic de la Universitat de València, ha aconseguit mètodes d'extracció d'ADN d'animals recol·lectats en camp en condicions no ideals. En concret, han obtingut ADN de qualitat d'una espècie de nudibranqui –mol·luscos marins sense petxina, de cos bla i colors cridaners– en sis de les 24 combinacions practicades. El treball s'ha publicat en la revista Ecology and Evolution
Esta investigació s'emmarca en la Iniciativa Catalana per a l’Earth Biogenome Project (CBP), una branca regional del projecte Earth BioGenome Project (EBP), que busca seqüenciar i catalogar els genomes de totes les espècies eucariotes conegudes. En concret, el CBP pretén seqüenciar els genomes de més de 40.000 espècies que habiten en territoris de parla catalana.
En l'estudi publicat es van avaluar 24 combinacions de conservació i extracció d'ADN en un exemplar del nudibranqui Peltodoris atromaculata. Com els nudibranquis solen recol·lectar-se en llocs remots, és necessari aplicar mètodes de conservació que poden afectar la qualitat de l'ADN, dificultant així l'obtenció del material requerit per les tècniques de seqüenciació de lectura llarga, aquelles que permeten generar acoblaments de lectures molt precisos i continus, fonamentals per a l'estudi de l'arquitectura genòmica i la resolució de regions complexes del genoma.
“Els resultats indiquen que l'èxit de les extraccions d'ADN d'alt pes molecular està influït pels mètodes de conservació. L'estudi aporta resultats clau en identificar combinacions eficaces de conservació i extracció d'ADN, la qual cosa permetrà generar genomes de referència d'alta qualitat i contribuir al coneixement i aprofitament sostenible de la biodiversitat marina”, Mária Džunková, investigadora de l'I2SysBio
“Els resultats indiquen que l'èxit de les extraccions d'ADN d'alt pes molecular està influït pels mètodes de conservació”, explica Mária Džunková, qui apunta que l'estudi aporta resultats clau en identificar combinacions eficaces de conservació i extracció d'ADN, “la qual cosa permetrà generar genomes de referència d'alta qualitat i contribuir al coneixement i aprofitament sostenible de la biodiversitat marina”.
Actualment, encara que només s'ha seqüenciat el genoma de l'1 % de les 2.545 espècies de nudibranquis conegudes, existix un creixent interés en este grup per la seua extraordinària diversitat biològica i els seus complexos mecanismes de defensa química, amb potencial en biotecnologia i farmacologia.
En esta investigació també han participat Inés Alberola-Mora, Oleanna Guerra-Font i Omar Daniel Espinoza-Calderón, personal investigador de l'Institut de Biologia Integrativa de Sistemes (I2SysBio), situat en l'àrea científic-acadèmica del Parc Científic de la Universitat de València (PCUV), a més de centre mixt del Consell Superior d'Investigacions Científiques (CSIC) i la Universitat de València (UV). Així mateix, ha participat Carles Galià-Camps, de la Universitat de Barcelona, l'Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBo) i del Blanes Centre for Advanced Studies (CSIC). En la investigació han col·laborat econòmicamentl'Institut d’Estudis Catalans, la Generalitat Valenciana i el Ministeri de Ciència, Innovació i Universitats.
Font: UV Notícies
No et perdes l'entrevista de Maria Dzunkova, investigadora de l'I2SysBio, en la nostra secció d'Europark
Inés Alberola-Mora, Oleanna Guerra-Font, Omar Daniel Espinoza-Calderón, Carles Galià-Camps, Mária Džunková: «Combination of Sample Preservation Approaches and DNA Extraction Methods for Long-Read Sequencing of Nudibranchs’ Genomes». Ecology and Evolution, 2025; 15:e71262. DOI: https://doi.org/10.1002/ece3.71262
--
Entrades recents